Как вариант переноса системы - подключить жесткий диск с новой машины, создать на нём разделы и файловые системы, а потом перенести всё с помощью "cp -a". Еще вариант - использовать dd (dd if="/dev/hda1" of="/dev/hdb1"), т.е. скопировать разделы целиком. Правда, при этом их размер на новом и старом диске должны совпадать.
Если же вести речь о сохранении только скачанных пакетов, то они сохраняются в директории /var/cache/apt/archives/.
Еще видел пример использования специальной программы -
aptoncdНу и последнее - возможно, имеет смысл задуматься об установке на новой машине ubuntu 8.10.