На сервере стоят FDD и (или) CD-DVD приводы? Вообще-то это очень не рекомендуется, а согласно нормам безопасности вообще запрещено. У Вас какая-то программа настойчиво обращается к диску. Начинать проверять лучше из списка автозагрузки. И крайне желательно провериться на вирусы.