Rishard
Обычно фильмы для уменьшения объема (при выкладывании на файлообменники) конвертируют с потерей качества, естественно. Если в процессе конвертации произошел сбой или оригинал уже содержал дефект (маловероятно при лицензионном диске), то Ваша последующая конвертация, как правило, ни к чему не приведет. Конвертор исправно выполнит свою работу, но дефект останется в 99 случаях из ста.
В таких случаях либо используйте совет, данный выше, либо сами вырезайте испорченный кусок. А хотите иметь копию высокого качества - придется покупать.