Здравствуйте, Rotten!
Запятая здесь однозначно не нужна (нет условий для ее написания). Определить смысловое ударение поможет только сам текст, т.е. человек сам должен определить, где нужно сделать паузу. В данном случае пауза делается после слова "предприятия" (по смыслу, не стоит же предприятие на рынке (базаре); здесь рынок понимается как сфера товарного обращения, а не ряды с палатками:)). В русском языке встречаются сложные предложения, которые трудно понять сразу, приходится перечитывать несколько раз. Что ж поделаешь, это плата за "великость" и "могучесть" нашего языка.
Трудно что-либо сказать по второму вопросу, а точнее найти это самое слово. Обратить внимание следует на научную сферу, например химию. В органической химии очень много длинных слов: аналиноформальдегидных смол - 20 букв и др.
А вот это я когда-то где-то вычитал:
шестидесятидевятимиллиметровый (30 букв - рекорд:))
С уважением, Александр

Здравствуйте, Rotten!

1. Никаких запятых, по-моему, в данном случае не нужно. В устной речи для выделения той или иной части предложения служит интонация. Что касается выделения в письменной речи, то здесь, конечно, сложнее. Полагаю, что Вас поймут однозначно, если ту часть, которую Вы хотите выделить, поставить в начале предложения. Например,
а) НА РЫНКЕ за время существования предприятия сменилась не только технология разработки и производства товара.
б) НЕ ТОЛЬКО ТЕХНОЛОГИЯ ПРОИЗВОДСТВА И РАЗРАБОТКИ ТОВАРА сменилась на рынке за время существования предприятия.

2. Длинные слова в русском языке: «метоксихлордиэтиламинометилбутиламиноакридин» (44 буквы, химическое вещество, другое название — акрихин), «восьмидесятивосьмимиллиметровое» (31 буква, ствол орудия), «рентгеноэлектрокардиографического» (33 буквы, самое длинное русское слово зарегистрированное в «Книге рекордов Гиннесса») и т. д.

С уважением.

Здравствуйте, Rotten!
1. Безусловно, в приведенном Вами предложении нужен только один знак препинания: точка в конце предложения. Чтобы избежать его двоякого понимания, нужно воспользоваться тем, что в русском языке относительно свободный порядок расположения слов в предложении и по законам актуального членения мы наиболее важную информацию выносим либо в начало предложения, либо в конец. Кроме того, простые, ничем не перегруженные предложения воспринимаются, как правило, только однозначно. Варианты:
1а) Предприятие уже несколько лет существует (занимает свое место) на рынке. За это время сменилась...
1б)Не только технология производства и разработки товара сменилась за время существования предприятия на рынке.
2а)За время существования предприятия рынок существенно изменился, причем это сказалось не только на технологиях производства и разработки товара.
2б)На рынке за время существования предприятия сменилась не только технология производства и разработки товара.


Приложение:
2. Чем длиннее слово, тем труднее его воспринимать. Именно по этой причине большинство слов в русском языке содержит не более 10 - 15 букв или звуков.Однако слова-гиганты иногда встречаются в официально-деловом и научном стилях. Примером может послужить такое слово, как ВОЗДУХОНЕПРОНИЦАЕМОСТЬ (22 буквы, 21 звук) и всевозмлжные ТРИГИДРОКАРБОНАТЫ и т.п. Если же подойти к вопросу с юмористической точки зрения, то самые длинные слова в русском языке - это СТОЛ, СТОП, СТОН (100 Л, 100 П, 100 Н).

Здравствуйте, Rotten!
1) Конечно же, никакой запятой здесь не нужно. Для передачи интонации (куда включим и логическое ударение) существуют знаки препинания. Но, к сожалению, их не так много чтобы они были в состоянии отразить звучание. Данное предложение как раз, как мне кажется, относится к такому случаю. Единственным выходом из данного положения считаю советы Mr. Andy и Шушариной Ирины Анатольевны о перестановке слов во фразе. Это во-вторых.
А во-первых, мне кажется, что, если я правильно понял Ваш комментарий на первый ответ, слово рынок вообще не нужно. Ведь любое предприятие существует для производства/переработки и продажи некого продукта. То есть оно a priori уже на рынке. Таким образом, время существования предприятия вообще и его существование на рынке - это одно и то же.
Исходя из этого фраза звучит так: "За время существования предприятия сменилась не только технология производства и разработки товара". Возникает ли сейчас проблема выделения нужной части?
2) Хотелось бы обратить внимание на то, что не только термины, например "дезоксирибонуклеиновая (кислота)" (22 буквы), но некоторые обычные слова могут быть очень длинными - достопримечательность (21 буква).
Удачи!