Здравствуйте, Lina!
Договор коммерческого найма, который был Вами заключен, регистрировать не нужно (гл. 35, ст. 164 ГК РФ, п. 5 Обзора практики разрешения споров, связанных с применением Федерального закона "О государственной регистрации прав на недвижимое имущество и сделок с ним", утв. Письмом Президиума Высшего Арбитражного Суда РФ от 16 февраля 2001 г. N 59).
Взыскать с нанимателя неуплаченные суммы по договору найма возможно. При этом Вам нужно доказать, что договор был заключен (письменная форма), а также то, что плата за жилое помещение не внесена (отсутствие платежных документов или поступлений на счет и т.п. в зависимости от формы расчетов, определенной договором). В принципе наличие договора в письменной форме дает неплохие шансы на взыскание долга.
Что касается неуплаты налогов, то в Ваших действиях усматриваются признаки налогового правонарушения, предусмотренного ст. 122 (Неуплата или неполная уплата сумм налога) НК РФ (см. Приложение). Однако такая ответственность наступит для Вас только за налогвые периоды 2004 г. и ранее. Что касается 2005, то, поскольку налоговый период еще не закончился, то и нет состава налогового правонарушения. Для привлечения Вас к ответственности нужно будет дополнительное судебное разбирательство, в рамках которого налоговые органы будут доказывать Вашу вину и факт совершения налогового правонарушения (ст. 108 НК РФ).
Поэтому обращаться или нет в суд - решать Вам.
С уважением, before.

Приложение:
Статья 122. Неуплата или неполная уплата сумм налога1. Неуплата или неполная уплата сумм налога в результате занижения налоговой базы, иного неправильного исчисления налога или других неправомерных действий (бездействия)влечет взыскание штрафа в размере 20 процентов от неуплаченных сумм налога.3. Деяния, предусмотренные пунктом 1 настоящей статьи, совершенные умышленно,влекут взыскание штрафа в размере 40 процентов от неуплаченных сумм налога.