Если BIOS не видит Hdd2, то ОперСистема с её драйверами не имеет значения. Потому что в работе с устройствами BIOS с его контроллерами - это первичный контакт, а ОС - вторичный обработчик. Когда ОС загружается, она читает BIOS, получает от него перечень подключенных устройств и загружает соответствующие драйверы для работы с ними.
Для прояснения ситуации лучше на время диагностики вообще отключить системный диск Hdd1 до тех пор, пока BIOS не увидит Hdd2.
Надо убедиться, что диск Hdd2 исправен и готов для работы. Если диск новый и не инициализирован, то возможно, его придётся инициализировать и проверить подключением к другой, более современной мат-плате с заведомо-исправными SATA-портами.
Форматировать большой диск лучше в системе Win7 или позднее, чтоб избавиться от необходимости
Выравнивания разделов .