Gusev Anatoly Vladimirovich:
Дайте побольше информации, сколько у вас винчестеров, сколько на них разделов. Из Вашего вопроса я предполагаю, что у Вас винчестер разбит на С:\, D:\, E:\, F:\.
Вопрос первый, как получилось, что системный диск у Вас D:\ ? Обычно C:\. Вы делаете образ системного диска, который у Вас является активным первичным, в ситеме может быть только один активный первичный диск. После клонирования на диск F:\, Вам надо его сделать активным !!! Это позволяют делать многие программы (Acronis, Partition magic, Paragon) Тогда Windows сможет загрузится. А потом, если диски будут "перепутаны" Вам придется сменить букву диска. Сделать это можно штатными средствами Windows. Пуск-Панель управления-Управление компьютером-Управление дисками-щелкаете на диске и выбираете "Изменить букву диска ..". Обратите внимание, чтобы заменить существующие буквы, Вам придется делать в 3 этапа. Например вы хотете заменить диск с буквой F на D, а D на F, тогда вы меняете букву F на любую возможную предположим Z, потом диск с буквой D меняете на F, а потом Z меняете на D.

Belotchik:
Ответ Belotchik
1.Вопрос первый, как получилось, что системный диск у Вас D:\ ?
При установке Windows можно задать букву другого раздела напр.D
2.После клонирования на диск F:\, Вам надо его сделать активным !!!
Это я знаю и делаю.
3.А потом, если диски будут "перепутаны" Вам придется сменить букву диска. Сделать это можно штатными средствами Windows.

Вы не правы.
Сама Windows не позволяет менять букву у системного раздела.

Гаряка Асмик:

3.А потом, если диски будут "перепутаны" Вам придется сменить букву диска. Сделать это можно штатными средствами Windows.

Вы не правы.
Сама Windows не позволяет менять букву у системного раздела.

Muxa:

3.А потом, если диски будут "перепутаны" Вам придется сменить букву диска. Сделать это можно штатными средствами Windows.

Вы не правы.
Сама Windows не позволяет менять букву у системного раздела.

Vasiliy83:

Спасибо, Vasiliy83.
Похоже, Вы, действительно, профессионал в отличии от других ответивших.
Хотя на вопрос :"Где Windows XP хранит букву диска?" Вы тоже не ответили,
но дали полезную ссылку и хороший совет. Попробую его.
Интересно, а как все-таки найти это тайное место?

Gusev Anatoly Vladimirovich:
так именно в разделе HKEY_LOCAL_MACHINE\SYSTEM\MountedDevices и хранятся все буквы для всех дисков, которые когда-либо были подключены к ПК.
в качестве значения параметра указывается идентификатор диска

http://support.microsoft.com/kb/223188/ru

Изменение буквы системного или загрузочного диска
Предупреждение. Неправильное изменение параметров системного реестра с помощью редактора реестра или любым иным путем может привести к серьезным неполадкам, требующим переустановки операционной системы. Корпорация Майкрософт не гарантирует устранения этих неполадок. При изменении реестра полагайтесь на свой опыт и знания.

1. Создайте резервную копию состояния системы и данных, находящихся на компьютере.
2. Войдите в систему с правами администратора.
3. Запустите программу Regedt32.exe.
4. Перейдите к следующему разделу реестра:
HKEY_LOCAL_MACHINE\SYSTEM\MountedDevices
5. Щелкните раздел MountedDevices.
6. В меню Безопасность выберите пункт Разрешения.
7. Предоставьте группе «Администраторы» право «Полный доступ». После выполнения описанных ниже действий необходимо восстановить права, существовавшие ранее.
8. Закройте программу Regedt32.exe и запустите программу Regedit.exe.
9. Найдите следующий раздел реестра:
HKEY_LOCAL_MACHINE\SYSTEM\MountedDevices
10. Найдите параметр, содержащий букву, которая должна быть присвоена диску. В данном случае это параметр «\DosDevices\C:».
11. Щелкните правой кнопкой мыши параметр \DosDevices\C: и выберите команду Переименовать.

Примечание. Для переименования этого параметра вместо программы Regedt32 необходимо использовать программу Regedit.
12. В новом имени укажите одну из неиспользуемых на данный момент букв (например «\DosDevices\Z:»).

Теперь буква C свободна.
13. Найдите параметр, соответствующий букве диска, которую необходимо изменить. В данном случае это параметр «\DosDevices\D:».
14. Щелкните правой кнопкой мыши параметр \DosDevices\D: и выберите команду Переименовать.
15. Укажите имя с учетом новой буквы диска (в данном случае — «\DosDevices\С:»).
16. Выделите правой кнопкой мыши параметр \DosDevices\Z:, выберите команду Переименовать и измените имя на «\DosDevices\D:».
17. Закройте программу Regedit и запустите Regedt32.exe.
18. Установите существовавшие ранее разрешения для группы «Администраторы» (как правило, это разрешение «Только чтение»).
19. Перезагрузите компьютер.

P.S.
Администраторы, добавьте ЭТО в мой ответ

Так ЭТО уже написал Vasiliy83 , ну почти написал.

Muxa:
Я добавлю в свою ответ, если Вы не против. Я не могу редактировать чужие.

2Гаряка Асмик нет, я не против

2Belotchik
а по поводу что уже написоно - каюсь, не посмотрел ))))
просто вот так вот быстрее вышло: ---> URL >>

На Ваше "Вы тоже не ответили…как все-таки найти это тайное место?" - попытаюсь удовлетворить Ваше любопытство. Корпорац Microsoft (кот-ю любят поносить наши обыватели, ничего лучшего не изобретшие) подарила нам чудесный инструм: Поиск. Он позв искать компы в сети, людей и инфо в инете, файлы на диске… Вы можете этим инструмом поискать фрагменты буквы диска. Откройте редактор реестра (Пуск \ Выполнить \ RegEdit) , клав-сочетанием Wind+F откройте панель Поиск и в строке "Найти" задайте C:
Можно искать с самого начала (если выделен заголовок "Мой компьютер") или с любого выделенного места (HKEY_LOCAL_MACHINE\SYSTEM). Если найденное значение не подходит по смыслу, то жмите клавишу F3 (искать далее), и Вы увидите сотни найденных значений с адресацией по букве диска.

Но, как Вы поняли из ответов уважаемых экспертов, буква диска - это такая же игра, как Имя человека. Имя служит для ускорения/удобства вызова/поиска человека, но от смены имени человек не изменится. Так и буква диска прописана лишь внутри самой системы, но когда BIOS-загрузчик принимает решение, которую систему загрузить в ОперПамять - ему нет дела до букв, он не видит эти буквы, инфо о них будет лишь потом зачитана из загруженной ОС.

Посмотрите в корневой \boot.ini как в нём задана загружаемая по умолчанию ОС:
default=multi(0)disk(0)rdisk(0)partition(1)\WINDOWS
А вот как ОС помнит себя: SystemPartition=\Device\HarddiskVolume1 (в [Hklm\System\Setup]), SystemBootDevice=multi(0)disk(0)rdisk(0)partition(1) (в [Hklm\System\CurrentControlSet\Control])

То есть: чтоб "пересадить" систему на др букву, надо исправить сотни параметров: не только букву диска, но и значения найденные по partition, Volume, и ещё по длинным гекса-кодам, которые не всегда отображ-ся в реестре!

Вывод: если всё-таки удастся изменить системе её букву диска, то это будет такая же система-инвалид, как если человеку сменить имя или поменять правую и левую руки местами. Как и советует Microsoft, такая дорогостоящая (по времени) манипуляц оправдана лишь для восстановления особо-ценных данных в системе с непредвиденно-сменившейся буквой. А если мы достаточно мудры, чтоб хранить данные на не-сис-разделе, то гораздо быстрее и надёжнее пере-установить систему и её Приложения, чем убивать время на изучение работы некорректных продуктов от Acronis.
По ответу N263736: для вызова апплета УправлениеДисками запускайте DiskMgmt.msc (а не compmgmt )

Пожелания: Чтоб успеть вовремя (до установки) вмешаться и поправить букву устанавливаемй ОС, надо для начала не игнорировать букву, которую Вам отобразил её Инсталер. Мож временно скрыть мешающие разделы, перехватывающие желаемую букву. Мож запускать Установку 2й ОС из ране-установленной ОС, из которой пока ещё легко поправить букву будущему сис-разделу.
Успехов!