Здравствуйте, Фиала.
В соответствии с ч.2 ст.166 ТК особенности направления работников в служебные командировки устанавливаются в порядке, определяемом Правительством Российской Федерации.
В соответствии с ст.167 ТК при направлении работника в служебную командировку ему гарантируются сохранение места работы (должности) и среднего заработка, а также возмещение расходов, связанных со служебной командировкой.
Особенности направления работника в командировку определены в
Положении об особенностях направления работников в служебные командировки утверждённом Постановлением Правительства РФ от 13.10.2008 N 749.
Особенности направления в заграничную командировку определены в п.16-23.
Обратите внимание, основной критерий здесь -
возмещение расходов, связанных со служебной командировкой! Если суточные и проживание ему оплачивала принимающая сторона, то работник ни каких расходов в этом плане не нёс, а, следовательно, работодатель ему ничего тут не должен. Вы должны иметь договор с организацией 2, и получить от них документальное подтверждение, что она оплатила суточные и проживание.
Прокуратуре ответьте, что ничего Вы работнику не обязаны, поскольку всё оплатила организация 2, и представьте копии документов.