гм, а галочки снимите примените, потом поставьте и примените,
мне помогло
потеря срабатывания на переключение клавиатуры у меня лечилось или так или перезагрузка компа если брыкалось отдельное приложение, а в других всё работало,
да вот ещё попробуйте убить процесс ctfmon.exe, а потом его запустить ручками с командной строки (срабатывало когда брыкалась раскладка в терминальной сессии, на локальной ОС мне не попадалось но вдруг.).