Здравствуйте, Rustam!
Если ставите два кулера на выдув, то следует поставить один кулер на вдув. Откуда прохладный воздух будет заходить?
Ставьте что-нибудь от Zalman. Правда дорогие, но тихие. Я себе один поставил под винчестер. Вполне доволен.

Здравствуйте, Rustam!
Вентилятор на боковой стенке обычно находится напротив корзины с жёсткими дисками и ставится всегда на вдув,, а вентилятор на задней стенке на выдув.
То что случится с материнкой называется " улучшение теплового режима" и будет
только способствовать стабильной и надёжной работе длительное время..

Здравствуйте, Rustam!
Если поставить второй куллер, то блок питания, из-за резко увеличившейся нагрузки не выдержит и комп не сможет запуститься, поэтому второй куллер надо будет втыкать во время работы, сразу после запуска. (Шутка)
Ничего. Просто пыли больше будет вытягивать, и может быть температура желаза при нагрузке упадет на пару градусов. Не больше.

Здравствуйте, Rustam!
Вот что накопал.
Начать нужно с установки вентиляторов на переднюю и заднюю стенки. Первый — на вдув, второй — на выдув. Таким образом создается эффект сквозняка: кубические литры воздуха вдуваются спереди, образуя воздушный поток, который несется по корпусу, неся всем нуждающимся глоток свежего воздуха. Нагревшись, выдувается он с помощью вентилятора, установленного на задней стенке. Эффективность зависит от скоростей вращения крыльчаток вентиляторов. Выше скорость — лучше охлаждение, но сильнее шум; ниже скорость — хуже охлаждение, но меньше шума или он вообще отсутствует. Как говорится, ищите золотую середину! Скорость крыльчаток вентиляторов рекомендуется устанавливать в двух сочетаниях: 1) скорости равны; 2) на вдув быстрее, чем на выдув. Чтобы воздушный поток свободно проходил от одного конца корпуса до другого, нужно убрать с его пути все принадлежности, которые могут ему помешать: шлейфы, провода БП и т.п. Их можно сдвинуть к стенке, ближайшей к материнской плате. Также в продаже и в комплекте с некоторыми материнскими платами встречаются аэродинамические шлейфы. Само слово "аэродинамические" говорит нам, что сами по себе они не препятствуют движению воздуха.

Очень часто встречаюсь со следующим неправильным сочетанием: на выдув — быстрее, чем на вдув. Почему неправильным? Да потому, что в таком случае давление внутри корпуса будет уменьшаться, а потому для уравнивания с давлением внешней среды воздух будет сосаться изо всех щелей, которые есть у вас в корпусе: лотка CD-ROM`а, флоппи-дисковода и т.п., а вместе с воздухом будет проникать и пыль. Чтобы избежать попадания никому не нужных килограммов пыли через вдувающий вентилятор, можно установить некое подобие фильтра перед вдувающим вентилятором. Выбор материала довольно велик: начиная с мелкой марли и заканчивая капроновыми колготками:). Установка самодельных фильтров хоть и снизит эффективность, но лучше перестраховаться — мало ли что всосется:).

Подключении вентиляторов.
В принципе, подключить таковой можно несколькими способами:
• К материнской плате. Просто вставив фишку в соответствующий штекер на материнской плате. На вентилятор подается 12 V, скорость вращения максимальна.
• К molex-разъему провода БП. Найдите провода плюс и минус, идущие от вентилятора. Обычно таковыми являются красный и черный соответственно (на каждом проводке должно быть обозначение). Красному проводу БП соответствует напряжение 7 V, желтому — 12 V, черный — земля. Варьировать скорость можно в приличных пределах.

Боковой вентилятор преддозначен для воздухода для процессора. Поставить можно и сюда.