Здравствуйте, Jurasik!
Нужно понять, как приходит помеха - по эфиру или по питанию. Для этого нужно включить магнитолу от независимого источника питания 12 В (напр., взять акумулятор у соседа) при работающем двигателе. Если помеха остаётся, тогда нужно искать в высоковольтной проводке, возможно где-то шьёт... (кстати, не меняли ли Вы высоковольтные провода? У меня был случай, когда приятель заменил штатные В.В. провода на медные силиконовые от грузовиков - вот тогда такое началось.... Помехи - это было самое безободное из всего "букета").
Если помеха идёт по питанию - это самое простое. Нужно найти готовый, или сделать самому дрссель. Проще всего намотать десятка полтора-два витков провода сечением не менее 2,5 кв.мм (ток современные магнитолы потребляют немаленький) на подходящий по размерам сердечник от трансформатора или ферритовое кольцо и включить этот дроссель последовательно в цепь "+"питания (обоих проводов), после дросселя , непосредственно перед магнитолой включить конденсатор микрофарад на 500-1000, рабочим напряжением не менее 12 В.
И будет Вам счастье....))))
Если непонятно, пишите в личку.

Здравствуйте, Jurasik!
Вы не указали модель магнитолы. Поэтому ответы общие.
1. У LG магнитолы после предохранителя идет обычно
Filter Box. Надоть добавить или заменить на Т-образный
фильтр - две индуктивности, а между ними конденсатор
на корпус.
2. Какая антенна ? Иде стоит ?
Надоть дальше от движка и в размер для УКВ диапазона
3. Обычно имп.автомагнитола в доп.кожухе

Здравствуйте, Jurasik!
Попробуйте стандартную схему подавления помех по питанию - П-фильтр
Перекладина П - это мощный дроссель (ферритовое кольцо с обмоткой, можно с двумя, если хотите). С направлениями включения поэксперементируйте сами. ноги П - конденсаторы. После фильтра - еще один конденсатор, электролитический, большой емкости. Фильтр ставьте поближе к магнитоле.

Если такая защита не поможет - попробуйте запитать прибор от отдельной батарейки и включить двигатель. Если помеха появится снова, значит наводка пролезает не по питанию (очень возможно, что так оно и есть). В таком случае (проблема с внутренней конструкцией магнитолы) попробуйте воспользоваться дополнительным экраном к антенному кабелю и качественной внешней антенной.

Советские девайсы имели очень неплохие шумоподавители. Здесь Вы абсолютно правы!

Здравствуйте, Jurasik!
Советую проверить работу генератора установленного на Вашей машине. Можна конечно бороться с помехами(установка электролитического конденсатора большой ёмкости паралельно Вашей автомагнитоле), но впринципе это сродни стрельбе по мухам из гаубицы.

Здравствуйте, Jurasik!
Нужен фильтр по питанию магнитолы или проверить проверить высоковольтные провода на свечи и трамблер, там должно быть сопротивление иногда его выбрасывают. Но Вам скорее нужен фильтр.
1. Купить готовый.
2. Выдрать из старой магнитолы. (обычно пара конденсаторов на общий и между ними в разрыв +12 дроссель на кольце)
3. Собрать по схеме старой магнитолы.
4. Собрать полностью самодельный. см п 2. Конденсаторы до 1 мкф не электролитические. Все подбирается опытным путем.