Если специфических задач нет и не нужны SAS/SCSI, то вся разница возможно в техподдержке. Присматривайте за температурой

Здравствуйте! "предыдущие системные администраторы" потому их и использовали, что на протяжении многих лет никаких особых требований во многих организациях к "серверам" не было.... Конечно выбирали помощнее...Но если компьютер используется только для организации сети 10 компьютеров без установки множества специальных серверных приложений..то можно использовать любой компьютер. Так что как такового понятия "серверных материнских плат" не существует. Существуют серверные ОС.
"Официальные" драйвера можно найти на сайте производителя (если компьютеры не очень старые) и (или) в сети, узнав визуально тип MB или с помощью наверняка Вам известных тестовых программ.
"...десктопную материнскую плату"...любую, удовлетворяющую Вашим задачам (побольше памяти, помощнее процессор). Ну уж никак не хуже системных требований, предъявляемых выбранной ОС (лучше с приличным запасом). Диск с драйверам прилагается, как правило, даже если поставка не "retail"...

А что подразумевается под "специфичными задачами"?
Первый сервер - Windows Server 2008 R2 x64 - контроллер домена, MS SQL Server 2008 STD с 2-3 SQL-базами для 1С, файлопомойка, сервер корпоративного антивируса.
Второй сервер - Windows Server 2008 R2 x64 или Windows Server 2003 R2 x86 - резервный контроллер домена, интернет-шлюз (ISA/Forefront TMG), почтовый сервер (скорее всего MDaemon).

Сейчас на данных "серверах" ничего не стоит. Они были куплены/собраны предыдущим админом и не были опробованы "в деле".
Соответсвенно на первом сервере хороший 4-х ядерный процессор, 16 ГБ DDR3 и RAID-1 массив из двух дисков.
Здесь я планирую установить Windows Server 2008 R2 x64.
Второй сервер был явно собран из старых запчастей: двухъядерный Pentium D, 4ГБ ОЗУ, RAID-1 массив из двух дисков.

Я бы вообще сделал бы второй сервер на основе Linux, но останавливает необходимость иметь резервный контроллер домена.

Как я написал чуть позднее Вашего сообщения, первый "сервер" никто ещё пока не использовал. Он был куплен буквально месяца 3 назад, за два месяца до моего прихода. Не знаю, почему тогда не купили действительно сервер; наверное решили сэкономить.
Второй сервер по сути обычный компьютер четырёхлетней давности, разве что с RAID-1 массивом из двух обычных (не Raid Edition) HDD.
Но и задачи у этого сервера не высокие: интернет-шлюз для 40 ПК и почтовик.

Понятие "серверных материнских плат" ещё как существует! При производстве таких плат тот же Intel гарантирует, что они будут работать 24/7 в течение долгих лет. Там и свои чипсеты, оперативная память с коррекцией ошибок - всё ради надёжности. Я уж не говорю о платах с двумя процессорами! Да и RAID-контроллеры на такие платы ставят получше. На "домашних игровых" мат. платах RAID-контроллер обычно является ненужным владельцу дополнением.
Во всех организациях, где я работаю, я стараюсь приобретать всё же серверные компоненты - выходит на 20-30% дороже, но потенциально надёжнее.

Про поиск оф. драйверов в сети - я специально указал в вопросе модели материнских плат и разумеется предварительно посмотрел наличие оф. драйверов.
К сожалению, Intel с некоторых пор перестала выпускать оф. драйвера серверных ОС для десктопных материнских плат. Разумеется, Windows Server 2008, несущая в себе множество драйверов, определит все устройства, учитывая, что в первом сервере у меня Intel-овская мат. плата.
Для второго сервера есть оф. драйвера только под Windows Server 2003, ведь той плате уже 4-5 лет, если не ошибаюсь. Но ставить на второй сервер Windows Server 2003 я не рискую, потому что этот сервер будет резервным контроллером домена в домене Windows Server 2008. Есть подозрения, что работать такая связка не будет.