Лаврентьев Дмитрий Сергеевич, переустановка поверх и не поможет. Форматировать диск надо перед установкой, что естественно уничтожит всё на диске вместе с вирусами. Но это если ничего не поможет. Сначала советую соспользоваться предложением Черепанова Михаила Яковлевича, и проверить диски с помощью
Dr.Web LiveCD либо с другого LiveCD запустить свежий
CureIt